As diferenças morfofisiológicas dos parasitos intestinais exigem distintas abordagens de coloração e são um desafio para o diagnóstico por microscopia óptica de luz convencional. Computadores podem aprimorar esta tarefa pelas ferramentas de segmentação semântica. Por esta razão, desenvolvemos um método de coloração temporária que melhora a tarefa de segmentação e classificação computacional pela rede nnU-Net aplicando solução de Fucsina e Tinta Nanquim (Tinta da China) em alíquotas fecais imediatamente antes de seu processamento pelas técnicas parasitológicas de TF-Test® Convencional (TFT-Conv) e Modificada (TFT-Mod), para 14 espécies de parasitos intestinais do homem. Um total de 1.541 fotomicrografias contendo parasitos foi dividido em conjuntos para validação e teste dos modelos da rede. Parasitos corados em tons de rosa e fúcsia contrastam bem com o plano de fundo coberto pelo Nanquim. Ovos e larvas de metazoários tendem a se corar mais intensamente que cistos, oocistos de protozoários. O desempenho médio dos modelos durante a segmentação teve Coeficiente de Similaridade de Dice de 0,77 no banco de dados de TFT-Conv e de 0,75 no banco de imagens de TFT-Mod. Durante a classificação, os modelos atingiram 98% de sensibilidade (kappa=0,968) para TFT-Conv e 95,7% (kappa= 0,964) para TFT-Mod. Os resultados sugerem que o tipo de processamento fecal interfere na sensibilidade dos algoritmos de segmentação e classificação, especialmente para as espécies Enterobius vermicularis, Blastocystis spp., Hymenolepis spp. e Entamoeba histolytica/E. dispar e Iodamoeba butschlii. As causas do baixo desempenho na classificação de Schistosoma mansoni podem ter relação com a variação da concentração de parasitos e a presença de impurezas no campo de microscopia. Nós desenvolvemos bancos de imagens originais a partir de um estudo sistemático de métodos de coloração universal, que permite o treinamento diagnóstico, reduz o viés diagnóstico e dá suporte ao desenvolvimento de modelos computacionais. O uso de coloração temporária reduz a necessidade de utilização de equipamentos de diagnóstico de alto custo na rotina laboratorial.